美國反恐體系的運作自911重大恐怖攻擊事件後經歷了重大重新整合,於2003年成立了國土安全部作為應對恐怖主義和其他高風險安全威脅的整體應對機構。該機構整合了22個聯邦機構,重新整併為四大轄下國土安全部門的分支進行運作,分別為邊境暨運輸安全部門(Border and Transportation Security)、緊急防備暨應變部門(Emergency Preparedness and Response)、化學、生物、輻射與核子反制措施部門(Chemical, Biological, Radiological and Nuclear Countermeasures)、情報分析與基礎建設保護部門(Informatic on Analysis and Infrastructure Protection)維持日常美國國土安全部運作。